По мере того, как Фалуньгун становится все более популярным, появляются первые признаки угнетения со стороны государства. Вскоре после того, как книги Фалуньгун были названы бестселлерами, они стали запрещены к публикации по внутреннему распоряжению от 24 июля, изданному Бюро новостей Китая, подразделением Министерства пропаганды. Документ обвиняет Фалуньгун в «распространении суеверий». Первая крупная государственная статья в средствах массовой информации, критикующая Фалуньгун, выходит в газете Guangming Daily 17 июня 1996 года.

Бюро общественной безопасности проводит расследование того, следует ли считать Фалуньгун «культом зла», но расследование приходит к выводу:  “доказательств не найдено”.

Бюро № 1 Министерства общественной безопасности выпускает Документ № 555 под названием «Уведомление о расследовании Фалуньгун», в котором утверждается, что Фалуньгун является еретическим культом. Министерство начинает серию расследований в поисках доказательств в поддержку заключения. Средства включают в себя прослушивание телефонных линий, наблюдение за добровольцами, обыски в домах, конфискацию личных вещей. Различные формы (незаконных) преследований происходят со стороны китайской полиции, включая срыв общественных утренних учений при помощи водных пушек и закрытие определенных мест для занятий. В некоторых районах оказываются разграблены дома.

Получив поток писем с озабоченностью, Цяо Ши, который только что закончил срок полномочий председателя Постоянного комитета Всекитайского собрания народных представителей и работал в Политбюро, ведет собственное расследование утверждений в документе 555, к которому присоединились другие высокопоставленные члены Конгресса. После нескольких месяцев исследований, группа пришла к выводу, что «Фалуньгун имеет сотни преимуществ для китайского народа и нации и не приносит никакого вреда».

Национальная спортивная комиссия Китая начинает собственное расследование Фалуньгун. Главный следователь заявил 20 октября: «Мы убеждены, что упражнения и эффективность Фалуньгун превосходны. Он проделал невероятную работу для улучшения стабильности и этики общества. Это должно быть должным образом подтверждено».

Исследование, проведенное Государственной комиссией по спорту Китая, показывает, что более 70 миллионов человек практикуют Фалуньгун в Китае.

В государственных СМИ усиливаются атаки на Фалуньгун, несмотря на продолжающиеся позитивные сообщения, указывающие на внутренние разногласия среди политического руководства Китая. Приверженцы Фалуньгун реагируют на критику, посещая, а иногда и обращаясь к сотрудникам местных газет и телеканалов, стремясь повысить точность сообщений. Такие события происходят в Пекине, Тяньцзине, Гуанчжоу и других крупных городах.

Официальный представитель Национальной комиссии по спорту Китая, выступая с US News & World Report, сообщает, что до 100 миллионов человек, вероятно, занимаются данной практикой. Чиновник подчеркивает, что практика спасает национальную систему здравоохранения Китая, заявляя, что «премьер Чжу Жунцзи очень рад этому».

Известный марксист-атеист Чжуннаньхай Хе Цзосю осуждает Фалуньгун и цигун в целом в журнале колледжа в Тяньцзине. Местные практикующие Фалуньгун собираются в Тяньцзине, с просьбой журнал исправить вред, нанесенный их репутации.

Хотя собрание проходит мирно, 23 и 24 апреля задействуются сотрудники полиции, 45 практикующих арестованы, некоторые избиты. Когда практикующие просят власти Тяньцзиня освободить арестованных, им говорят, что приказы пришли из Пекина; им также сообщают, что если они хотят подать петицию, они должны отправиться в столицу.

На следующий день, 25 апреля, около 10 000 приверженцев Фалуньгун из Пекина, близлежащего Тяньцзиня и других городов этого района собрались возле Офиса петиций Государственного совета в Пекине. Этот офис расположен по соседству с Чжуннаньхай, жилым комплексом лидеров коммунистической партии. Истцы высказывают свою обеспокоенность по поводу арестов и злоупотреблений в Тяньцзине накануне и просят освободить арестованных в Тяньцзине, снять запрет на публикацию книг о Фалуньгун и возобновить их практику без вмешательства правительства.

Собрание было на самом деле удивительно мирным и организованным, несмотря на более поздние обвинения партии в том, что Фалуньгун захватил Чжуннаньхай.

Тогдашний премьер-министр Чжу Жунцзи встречается с представителями Фалуньгун в своем кабинете. К концу дня арестованные в Тяньцзине были освобождены, и собрание спокойно разошлось.

Однако через несколько часов лидер коммунистической партии Цзян Цзэминь выступил против смягчающей позиции Чжу и заявил, что, если не сможет победить Фалуньгун, партия станет «посмешищем».

В статье Ассошиэйтед Пресс говорится, что у Фалуньгун Китая «больше членов, чем у Коммунистической партии - по крайней мере, 70 миллионов, по данным Государственной администрации спорта». В двух новостях New York Times на следующий день число практикующих Фалуньгун указывается как 70 миллионов, со ссылкой на правительство Китая. В статье говорится, что группа «даже по оценкам китайского правительства имеет больше членов, чем Коммунистическая партия».

«Офис 610» создан по указанию главы Коммунистической партии Китая Цзян Цзэминя. Его задача: планировать, организовывать и осуществлять всеобъемлющее подавление Фалуньгун. Цзян предоставляет ему власть над всеми местными уровнями полиции, правительства и судов. Офис 610 позже стал основным инструментом для ареста, пыток и убийств практикующих Фалуньгун.

20 июля 1999 года коммунистическое руководство Китая официально запретило Фалуньгун.

Начиная с собрания 25 апреля и до середины июля, сторонники по всему Китаю сообщают о том, что полицейские в штатском следят за ними и допрашивают их, поскольку партия собирает списки приверженцев и окончательно готовится к последующему запрету.

20 июля 1999 года по всему Китаю полиция начала арестовывать сторонников, которых они считают ключевыми организаторами, и обыскивать их дома. 22 июля 1999 года начинается медийный блиц. Радиоволны, телевизионные экраны и газетные колонки заполнены атаками на Фалуньгун. По городским улицам и в студенческих городках проезжают грузовики со звуковым сопровождением, предупреждая людей, что практика Фалуньгун в настоящее время запрещена. По условиям запрета, также запрещен протест против него (ссылка на отчет).

За этим последовали массовые аресты, а также обыски, похищения и конфискация материалов, связанных с Фалуньгун. Параллельно запускается общенациональная пропагандистская кампания против Фалуньгун.